Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK11BP21127 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.9 ms