Protein–RNA interactions for Protein: P17301

ITGA2, Integrin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA2P17301 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA2P17301 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA2P17301 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA2P17301 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA2P17301 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA2P17301 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA2P17301 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA2P17301 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA2P17301 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA2P17301 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA2P17301 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA2P17301 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA2P17301 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA2P17301 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA2P17301 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA2P17301 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA2P17301 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA2P17301 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA2P17301 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA2P17301 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA2P17301 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ITGA2P17301 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA2P17301 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA2P17301 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA2P17301 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA2P17301 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA2P17301 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA2P17301 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA2P17301 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA2P17301 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA2P17301 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA2P17301 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA2P17301 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA2P17301 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA2P17301 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA2P17301 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA2P17301 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA2P17301 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA2P17301 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA2P17301 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA2P17301 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA2P17301 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA2P17301 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA2P17301 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA2P17301 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA2P17301 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA2P17301 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA2P17301 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA2P17301 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA2P17301 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA2P17301 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA2P17301 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA2P17301 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA2P17301 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA2P17301 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA2P17301 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ITGA2P17301 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGA2P17301 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGA2P17301 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGA2P17301 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGA2P17301 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGA2P17301 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGA2P17301 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGA2P17301 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGA2P17301 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGA2P17301 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGA2P17301 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGA2P17301 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGA2P17301 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGA2P17301 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGA2P17301 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGA2P17301 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGA2P17301 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGA2P17301 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGA2P17301 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGA2P17301 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGA2P17301 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGA2P17301 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGA2P17301 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGA2P17301 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGA2P17301 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGA2P17301 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGA2P17301 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGA2P17301 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGA2P17301 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGA2P17301 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGA2P17301 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGA2P17301 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ITGA2P17301 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ITGA2P17301 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ITGA2P17301 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ITGA2P17301 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ITGA2P17301 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ITGA2P17301 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA2P17301 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA2P17301 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA2P17301 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA2P17301 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA2P17301 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA2P17301 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms