Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 OPRM1-210ENST00000452687 1352 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 TCEAL1-201ENST00000372624 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 TCEAL1-202ENST00000372625 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 AC234781.1-201ENST00000444722 459 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 AC108729.1-201ENST00000487812 947 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 LINC02434-201ENST00000502419 677 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 AC010460.2-201ENST00000509054 677 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 AC124069.1-201ENST00000517454 735 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 AC131902.1-201ENST00000521558 594 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 ZNF506-204ENST00000545006 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 LINC01892-202ENST00000583985 540 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 AP003117.1-201ENST00000602771 554 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 AC091614.1-201ENST00000606898 879 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 OR10AE1P-201ENST00000606962 1029 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 AL049536.1-201ENST00000625043 744 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 FCHO2-201ENST00000287761 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 AL442071.1-201ENST00000289890 558 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 C3orf49-201ENST00000295896 1292 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 AC104162.1-204ENST00000443346 708 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 AL356272.1-201ENST00000454538 832 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 MTND6P32-201ENST00000457611 483 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 LINC02509-201ENST00000508790 691 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 AP003028.1-203ENST00000525832 444 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 AP000462.1-201ENST00000535704 818 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 LINC02407-202ENST00000553247 1083 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 AC090246.1-201ENST00000616499 426 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 LINC00102-201ENST00000445785 1340 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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