Protein–RNA interactions for Protein: P10070

GLI2, Zinc finger protein GLI2, humanhuman

Predictions only

Length 1,586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI2P10070 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GLI2P10070 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GLI2P10070 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GLI2P10070 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GLI2P10070 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GLI2P10070 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GLI2P10070 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GLI2P10070 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GLI2P10070 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GLI2P10070 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GLI2P10070 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GLI2P10070 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GLI2P10070 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GLI2P10070 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GLI2P10070 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GLI2P10070 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GLI2P10070 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GLI2P10070 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GLI2P10070 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GLI2P10070 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GLI2P10070 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GLI2P10070 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GLI2P10070 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GLI2P10070 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GLI2P10070 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GLI2P10070 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GLI2P10070 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GLI2P10070 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GLI2P10070 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GLI2P10070 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GLI2P10070 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GLI2P10070 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GLI2P10070 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GLI2P10070 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GLI2P10070 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GLI2P10070 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GLI2P10070 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GLI2P10070 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GLI2P10070 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GLI2P10070 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GLI2P10070 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GLI2P10070 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GLI2P10070 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GLI2P10070 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GLI2P10070 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GLI2P10070 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GLI2P10070 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GLI2P10070 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GLI2P10070 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GLI2P10070 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GLI2P10070 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GLI2P10070 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GLI2P10070 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GLI2P10070 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GLI2P10070 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GLI2P10070 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GLI2P10070 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GLI2P10070 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GLI2P10070 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GLI2P10070 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GLI2P10070 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GLI2P10070 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GLI2P10070 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GLI2P10070 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GLI2P10070 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GLI2P10070 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GLI2P10070 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GLI2P10070 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GLI2P10070 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GLI2P10070 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GLI2P10070 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GLI2P10070 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GLI2P10070 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GLI2P10070 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GLI2P10070 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GLI2P10070 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GLI2P10070 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GLI2P10070 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GLI2P10070 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GLI2P10070 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GLI2P10070 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GLI2P10070 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GLI2P10070 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GLI2P10070 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GLI2P10070 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GLI2P10070 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GLI2P10070 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GLI2P10070 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GLI2P10070 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GLI2P10070 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GLI2P10070 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GLI2P10070 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GLI2P10070 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GLI2P10070 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GLI2P10070 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GLI2P10070 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GLI2P10070 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GLI2P10070 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GLI2P10070 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GLI2P10070 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms