Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW3

SMIM10L1, Small integral membrane protein 10-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L1P0DMW3 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SMIM10L1P0DMW3 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM10L1P0DMW3 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM10L1P0DMW3 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM10L1P0DMW3 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM10L1P0DMW3 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM10L1P0DMW3 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM10L1P0DMW3 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM10L1P0DMW3 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM10L1P0DMW3 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM10L1P0DMW3 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM10L1P0DMW3 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM10L1P0DMW3 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM10L1P0DMW3 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM10L1P0DMW3 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM10L1P0DMW3 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM10L1P0DMW3 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM10L1P0DMW3 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM10L1P0DMW3 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM10L1P0DMW3 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM10L1P0DMW3 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM10L1P0DMW3 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM10L1P0DMW3 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM10L1P0DMW3 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM10L1P0DMW3 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM10L1P0DMW3 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM10L1P0DMW3 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM10L1P0DMW3 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM10L1P0DMW3 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM10L1P0DMW3 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM10L1P0DMW3 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM10L1P0DMW3 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM10L1P0DMW3 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM10L1P0DMW3 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM10L1P0DMW3 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM10L1P0DMW3 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM10L1P0DMW3 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM10L1P0DMW3 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM10L1P0DMW3 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM10L1P0DMW3 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM10L1P0DMW3 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM10L1P0DMW3 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM10L1P0DMW3 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM10L1P0DMW3 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM10L1P0DMW3 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM10L1P0DMW3 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM10L1P0DMW3 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM10L1P0DMW3 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM10L1P0DMW3 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM10L1P0DMW3 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM10L1P0DMW3 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM10L1P0DMW3 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM10L1P0DMW3 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM10L1P0DMW3 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM10L1P0DMW3 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM10L1P0DMW3 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM10L1P0DMW3 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM10L1P0DMW3 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM10L1P0DMW3 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM10L1P0DMW3 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM10L1P0DMW3 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM10L1P0DMW3 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM10L1P0DMW3 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM10L1P0DMW3 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM10L1P0DMW3 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM10L1P0DMW3 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM10L1P0DMW3 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM10L1P0DMW3 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM10L1P0DMW3 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM10L1P0DMW3 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM10L1P0DMW3 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM10L1P0DMW3 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM10L1P0DMW3 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM10L1P0DMW3 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM10L1P0DMW3 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM10L1P0DMW3 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SMIM10L1P0DMW3 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM10L1P0DMW3 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM10L1P0DMW3 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM10L1P0DMW3 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM10L1P0DMW3 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM10L1P0DMW3 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM10L1P0DMW3 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM10L1P0DMW3 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM10L1P0DMW3 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM10L1P0DMW3 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM10L1P0DMW3 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM10L1P0DMW3 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM10L1P0DMW3 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM10L1P0DMW3 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM10L1P0DMW3 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM10L1P0DMW3 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM10L1P0DMW3 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM10L1P0DMW3 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM10L1P0DMW3 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM10L1P0DMW3 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM10L1P0DMW3 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM10L1P0DMW3 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM10L1P0DMW3 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM10L1P0DMW3 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms