Protein–RNA interactions for Protein: P0DMQ9

C8orf89, Putative uncharacterized protein C8orf89, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf89P0DMQ9 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms