Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR1AO95602 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR1AO95602 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms