Protein–RNA interactions for Protein: O95273

CCNDBP1, Cyclin-D1-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1O95273 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCNDBP1O95273 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCNDBP1O95273 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms