Protein–RNA interactions for Protein: O75600

GCAT, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCATO75600 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCATO75600 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCATO75600 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCATO75600 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GCATO75600 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCATO75600 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCATO75600 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCATO75600 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCATO75600 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCATO75600 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCATO75600 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GCATO75600 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCATO75600 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCATO75600 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCATO75600 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCATO75600 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCATO75600 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCATO75600 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCATO75600 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCATO75600 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCATO75600 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GCATO75600 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GCATO75600 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCATO75600 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCATO75600 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCATO75600 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCATO75600 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCATO75600 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCATO75600 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCATO75600 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCATO75600 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCATO75600 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCATO75600 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GCATO75600 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCATO75600 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCATO75600 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCATO75600 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCATO75600 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCATO75600 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCATO75600 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCATO75600 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCATO75600 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCATO75600 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCATO75600 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCATO75600 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCATO75600 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCATO75600 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCATO75600 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCATO75600 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCATO75600 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCATO75600 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCATO75600 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCATO75600 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCATO75600 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCATO75600 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GCATO75600 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCATO75600 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCATO75600 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GCATO75600 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCATO75600 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GCATO75600 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCATO75600 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCATO75600 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCATO75600 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCATO75600 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCATO75600 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCATO75600 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCATO75600 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCATO75600 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCATO75600 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCATO75600 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCATO75600 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCATO75600 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCATO75600 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCATO75600 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCATO75600 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCATO75600 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCATO75600 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GCATO75600 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCATO75600 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCATO75600 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCATO75600 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCATO75600 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCATO75600 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCATO75600 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GCATO75600 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCATO75600 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCATO75600 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCATO75600 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCATO75600 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCATO75600 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCATO75600 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCATO75600 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCATO75600 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCATO75600 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCATO75600 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCATO75600 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCATO75600 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCATO75600 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GCATO75600 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms