Protein–RNA interactions for Protein: O43765

SGTA, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGTAO43765 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGTAO43765 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGTAO43765 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGTAO43765 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGTAO43765 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SGTAO43765 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGTAO43765 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGTAO43765 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGTAO43765 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGTAO43765 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGTAO43765 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGTAO43765 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGTAO43765 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGTAO43765 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGTAO43765 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SGTAO43765 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGTAO43765 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGTAO43765 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGTAO43765 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGTAO43765 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGTAO43765 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGTAO43765 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGTAO43765 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGTAO43765 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGTAO43765 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGTAO43765 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGTAO43765 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGTAO43765 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGTAO43765 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGTAO43765 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGTAO43765 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGTAO43765 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGTAO43765 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGTAO43765 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGTAO43765 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGTAO43765 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGTAO43765 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGTAO43765 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGTAO43765 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGTAO43765 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGTAO43765 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGTAO43765 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGTAO43765 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGTAO43765 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGTAO43765 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGTAO43765 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGTAO43765 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGTAO43765 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGTAO43765 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGTAO43765 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGTAO43765 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGTAO43765 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGTAO43765 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGTAO43765 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGTAO43765 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SGTAO43765 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGTAO43765 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SGTAO43765 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SGTAO43765 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGTAO43765 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGTAO43765 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGTAO43765 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGTAO43765 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGTAO43765 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGTAO43765 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGTAO43765 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGTAO43765 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGTAO43765 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SGTAO43765 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGTAO43765 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGTAO43765 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGTAO43765 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGTAO43765 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SGTAO43765 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGTAO43765 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGTAO43765 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGTAO43765 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGTAO43765 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGTAO43765 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGTAO43765 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGTAO43765 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGTAO43765 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGTAO43765 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGTAO43765 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGTAO43765 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGTAO43765 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGTAO43765 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGTAO43765 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SGTAO43765 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGTAO43765 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGTAO43765 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGTAO43765 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGTAO43765 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGTAO43765 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGTAO43765 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGTAO43765 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGTAO43765 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SGTAO43765 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGTAO43765 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SGTAO43765 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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