Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMAD6O43541 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms