Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CACNA1GO43497 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CACNA1GO43497 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CACNA1GO43497 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CACNA1GO43497 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CACNA1GO43497 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CACNA1GO43497 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CACNA1GO43497 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CACNA1GO43497 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.05■□□□□ 0
CACNA1GO43497 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CACNA1GO43497 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CACNA1GO43497 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
CACNA1GO43497 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
CACNA1GO43497 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
CACNA1GO43497 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ 0
CACNA1GO43497 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ 0
CACNA1GO43497 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CACNA1GO43497 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CACNA1GO43497 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CACNA1GO43497 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CACNA1GO43497 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
CACNA1GO43497 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CACNA1GO43497 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CACNA1GO43497 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CACNA1GO43497 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CACNA1GO43497 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CACNA1GO43497 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CACNA1GO43497 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CACNA1GO43497 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CACNA1GO43497 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CACNA1GO43497 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CACNA1GO43497 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CACNA1GO43497 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CACNA1GO43497 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CACNA1GO43497 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CACNA1GO43497 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CACNA1GO43497 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CACNA1GO43497 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CACNA1GO43497 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CACNA1GO43497 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CACNA1GO43497 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CACNA1GO43497 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CACNA1GO43497 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CACNA1GO43497 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1GO43497 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1GO43497 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1GO43497 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1GO43497 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1GO43497 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1GO43497 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1GO43497 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1GO43497 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1GO43497 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1GO43497 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1GO43497 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1GO43497 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1GO43497 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1GO43497 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1GO43497 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1GO43497 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1GO43497 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1GO43497 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1GO43497 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1GO43497 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1GO43497 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1GO43497 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1GO43497 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1GO43497 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1GO43497 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1GO43497 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1GO43497 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1GO43497 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1GO43497 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1GO43497 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1GO43497 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1GO43497 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1GO43497 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1GO43497 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1GO43497 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1GO43497 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1GO43497 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1GO43497 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1GO43497 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1GO43497 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1GO43497 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1GO43497 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1GO43497 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1GO43497 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1GO43497 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1GO43497 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1GO43497 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1GO43497 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1GO43497 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1GO43497 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1GO43497 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1GO43497 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1GO43497 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1GO43497 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1GO43497 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA1GO43497 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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