Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FANCAO15360 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FANCAO15360 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FANCAO15360 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FANCAO15360 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FANCAO15360 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
FANCAO15360 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FANCAO15360 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FANCAO15360 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FANCAO15360 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FANCAO15360 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FANCAO15360 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FANCAO15360 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FANCAO15360 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FANCAO15360 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FANCAO15360 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FANCAO15360 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FANCAO15360 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FANCAO15360 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FANCAO15360 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
FANCAO15360 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FANCAO15360 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FANCAO15360 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FANCAO15360 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
FANCAO15360 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FANCAO15360 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FANCAO15360 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
FANCAO15360 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FANCAO15360 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FANCAO15360 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
FANCAO15360 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FANCAO15360 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FANCAO15360 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FANCAO15360 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FANCAO15360 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
FANCAO15360 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FANCAO15360 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FANCAO15360 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FANCAO15360 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
FANCAO15360 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FANCAO15360 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FANCAO15360 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FANCAO15360 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FANCAO15360 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FANCAO15360 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FANCAO15360 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FANCAO15360 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC24■■□□□ 1.43
FANCAO15360 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FANCAO15360 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC24■■□□□ 1.43
FANCAO15360 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC24■■□□□ 1.43
FANCAO15360 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FANCAO15360 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FANCAO15360 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FANCAO15360 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FANCAO15360 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FANCAO15360 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FANCAO15360 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FANCAO15360 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FANCAO15360 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FANCAO15360 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FANCAO15360 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FANCAO15360 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FANCAO15360 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FANCAO15360 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FANCAO15360 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
FANCAO15360 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC24■■□□□ 1.43
FANCAO15360 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC24■■□□□ 1.43
FANCAO15360 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FANCAO15360 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FANCAO15360 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
FANCAO15360 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
FANCAO15360 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FANCAO15360 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC24■■□□□ 1.43
FANCAO15360 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FANCAO15360 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FANCAO15360 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FANCAO15360 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FANCAO15360 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FANCAO15360 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FANCAO15360 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FANCAO15360 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FANCAO15360 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FANCAO15360 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
FANCAO15360 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FANCAO15360 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FANCAO15360 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FANCAO15360 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FANCAO15360 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FANCAO15360 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FANCAO15360 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FANCAO15360 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FANCAO15360 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FANCAO15360 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FANCAO15360 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
FANCAO15360 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FANCAO15360 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FANCAO15360 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FANCAO15360 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FANCAO15360 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FANCAO15360 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms