Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NEDD8-MDP1E9PL57 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms