Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.5 ms