Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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C4orf47A7E2U8 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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C4orf47A7E2U8 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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C4orf47A7E2U8 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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C4orf47A7E2U8 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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C4orf47A7E2U8 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
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C4orf47A7E2U8 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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C4orf47A7E2U8 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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