Protein–RNA interactions for Protein: A4D1N5

Putative uncharacterized protein FLJ40288, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4D1N5 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
A4D1N5 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
A4D1N5 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
A4D1N5 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
A4D1N5 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
A4D1N5 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
A4D1N5 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
A4D1N5 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
A4D1N5 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
A4D1N5 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
A4D1N5 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
A4D1N5 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
A4D1N5 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
A4D1N5 TMEM169-202ENST00000406027 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
A4D1N5 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
A4D1N5 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
A4D1N5 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
A4D1N5 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
A4D1N5 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
A4D1N5 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
A4D1N5 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
A4D1N5 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
A4D1N5 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
A4D1N5 LINC00685-201ENST00000391707 428 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
A4D1N5 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
A4D1N5 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
A4D1N5 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
A4D1N5 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
A4D1N5 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
A4D1N5 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
A4D1N5 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
A4D1N5 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
A4D1N5 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
A4D1N5 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
A4D1N5 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
A4D1N5 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
A4D1N5 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
A4D1N5 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
A4D1N5 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
A4D1N5 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
A4D1N5 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
A4D1N5 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
A4D1N5 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
A4D1N5 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC11.05□□□□□ -0.64
A4D1N5 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
A4D1N5 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
A4D1N5 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
A4D1N5 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
A4D1N5 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
A4D1N5 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
A4D1N5 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
A4D1N5 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
A4D1N5 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
A4D1N5 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
A4D1N5 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
A4D1N5 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
A4D1N5 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
A4D1N5 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
A4D1N5 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
A4D1N5 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
A4D1N5 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
A4D1N5 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
A4D1N5 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
A4D1N5 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
A4D1N5 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
A4D1N5 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
A4D1N5 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
A4D1N5 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
A4D1N5 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
A4D1N5 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
A4D1N5 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
A4D1N5 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
A4D1N5 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
A4D1N5 MARVELD2-201ENST00000325631 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
A4D1N5 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
A4D1N5 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
A4D1N5 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
A4D1N5 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
A4D1N5 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
A4D1N5 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
A4D1N5 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
A4D1N5 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
A4D1N5 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
A4D1N5 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
A4D1N5 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
A4D1N5 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
A4D1N5 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
A4D1N5 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
A4D1N5 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
A4D1N5 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
A4D1N5 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
A4D1N5 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
A4D1N5 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
A4D1N5 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
A4D1N5 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
A4D1N5 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
A4D1N5 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
A4D1N5 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
A4D1N5 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
A4D1N5 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms