Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PIPSLA2A3N6 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms