Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TMED7Q9Y3B3 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms