Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G9

SBNO2, Protein strawberry notch homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO2Q9Y2G9 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SBNO2Q9Y2G9 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SBNO2Q9Y2G9 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SBNO2Q9Y2G9 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SBNO2Q9Y2G9 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SBNO2Q9Y2G9 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SBNO2Q9Y2G9 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SBNO2Q9Y2G9 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SBNO2Q9Y2G9 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SBNO2Q9Y2G9 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SBNO2Q9Y2G9 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SBNO2Q9Y2G9 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SBNO2Q9Y2G9 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SBNO2Q9Y2G9 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SBNO2Q9Y2G9 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SBNO2Q9Y2G9 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SBNO2Q9Y2G9 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SBNO2Q9Y2G9 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SBNO2Q9Y2G9 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SBNO2Q9Y2G9 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SBNO2Q9Y2G9 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SBNO2Q9Y2G9 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SBNO2Q9Y2G9 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SBNO2Q9Y2G9 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SBNO2Q9Y2G9 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SBNO2Q9Y2G9 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SBNO2Q9Y2G9 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SBNO2Q9Y2G9 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SBNO2Q9Y2G9 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SBNO2Q9Y2G9 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SBNO2Q9Y2G9 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SBNO2Q9Y2G9 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SBNO2Q9Y2G9 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SBNO2Q9Y2G9 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SBNO2Q9Y2G9 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SBNO2Q9Y2G9 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SBNO2Q9Y2G9 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SBNO2Q9Y2G9 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SBNO2Q9Y2G9 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SBNO2Q9Y2G9 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SBNO2Q9Y2G9 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SBNO2Q9Y2G9 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SBNO2Q9Y2G9 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SBNO2Q9Y2G9 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SBNO2Q9Y2G9 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SBNO2Q9Y2G9 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SBNO2Q9Y2G9 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SBNO2Q9Y2G9 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SBNO2Q9Y2G9 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SBNO2Q9Y2G9 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SBNO2Q9Y2G9 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SBNO2Q9Y2G9 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SBNO2Q9Y2G9 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SBNO2Q9Y2G9 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SBNO2Q9Y2G9 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SBNO2Q9Y2G9 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SBNO2Q9Y2G9 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SBNO2Q9Y2G9 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SBNO2Q9Y2G9 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SBNO2Q9Y2G9 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SBNO2Q9Y2G9 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SBNO2Q9Y2G9 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SBNO2Q9Y2G9 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SBNO2Q9Y2G9 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SBNO2Q9Y2G9 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SBNO2Q9Y2G9 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SBNO2Q9Y2G9 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SBNO2Q9Y2G9 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SBNO2Q9Y2G9 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SBNO2Q9Y2G9 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SBNO2Q9Y2G9 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SBNO2Q9Y2G9 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SBNO2Q9Y2G9 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SBNO2Q9Y2G9 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SBNO2Q9Y2G9 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SBNO2Q9Y2G9 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SBNO2Q9Y2G9 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SBNO2Q9Y2G9 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SBNO2Q9Y2G9 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SBNO2Q9Y2G9 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SBNO2Q9Y2G9 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SBNO2Q9Y2G9 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SBNO2Q9Y2G9 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SBNO2Q9Y2G9 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SBNO2Q9Y2G9 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SBNO2Q9Y2G9 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SBNO2Q9Y2G9 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SBNO2Q9Y2G9 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SBNO2Q9Y2G9 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SBNO2Q9Y2G9 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SBNO2Q9Y2G9 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SBNO2Q9Y2G9 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SBNO2Q9Y2G9 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SBNO2Q9Y2G9 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SBNO2Q9Y2G9 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SBNO2Q9Y2G9 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SBNO2Q9Y2G9 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SBNO2Q9Y2G9 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SBNO2Q9Y2G9 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SBNO2Q9Y2G9 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms