Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ9

TNRC6B, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6BQ9UPQ9 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNRC6BQ9UPQ9 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms