Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA2

FBXL4, F-box/LRR-repeat protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL4Q9UKA2 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FBXL4Q9UKA2 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms