Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TUBE1Q9UJT0 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms