Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SFMBT1Q9UHJ3 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms