Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MLH3Q9UHC1 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MLH3Q9UHC1 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms