Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU5

HMGXB4, HMG domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB4Q9UGU5 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HMGXB4Q9UGU5 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HMGXB4Q9UGU5 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HMGXB4Q9UGU5 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HMGXB4Q9UGU5 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HMGXB4Q9UGU5 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HMGXB4Q9UGU5 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HMGXB4Q9UGU5 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HMGXB4Q9UGU5 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HMGXB4Q9UGU5 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HMGXB4Q9UGU5 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HMGXB4Q9UGU5 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HMGXB4Q9UGU5 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HMGXB4Q9UGU5 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGXB4Q9UGU5 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGXB4Q9UGU5 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGXB4Q9UGU5 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGXB4Q9UGU5 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGXB4Q9UGU5 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGXB4Q9UGU5 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGXB4Q9UGU5 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGXB4Q9UGU5 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGXB4Q9UGU5 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGXB4Q9UGU5 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGXB4Q9UGU5 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGXB4Q9UGU5 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGXB4Q9UGU5 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGXB4Q9UGU5 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGXB4Q9UGU5 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGXB4Q9UGU5 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGXB4Q9UGU5 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGXB4Q9UGU5 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGXB4Q9UGU5 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGXB4Q9UGU5 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGXB4Q9UGU5 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGXB4Q9UGU5 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGXB4Q9UGU5 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGXB4Q9UGU5 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGXB4Q9UGU5 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGXB4Q9UGU5 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGXB4Q9UGU5 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGXB4Q9UGU5 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGXB4Q9UGU5 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGXB4Q9UGU5 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGXB4Q9UGU5 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGXB4Q9UGU5 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGXB4Q9UGU5 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGXB4Q9UGU5 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGXB4Q9UGU5 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGXB4Q9UGU5 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGXB4Q9UGU5 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGXB4Q9UGU5 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGXB4Q9UGU5 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HMGXB4Q9UGU5 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMGXB4Q9UGU5 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMGXB4Q9UGU5 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMGXB4Q9UGU5 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMGXB4Q9UGU5 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMGXB4Q9UGU5 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HMGXB4Q9UGU5 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMGXB4Q9UGU5 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMGXB4Q9UGU5 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HMGXB4Q9UGU5 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMGXB4Q9UGU5 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMGXB4Q9UGU5 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMGXB4Q9UGU5 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMGXB4Q9UGU5 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMGXB4Q9UGU5 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMGXB4Q9UGU5 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HMGXB4Q9UGU5 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMGXB4Q9UGU5 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HMGXB4Q9UGU5 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMGXB4Q9UGU5 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMGXB4Q9UGU5 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMGXB4Q9UGU5 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMGXB4Q9UGU5 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMGXB4Q9UGU5 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMGXB4Q9UGU5 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMGXB4Q9UGU5 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMGXB4Q9UGU5 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMGXB4Q9UGU5 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMGXB4Q9UGU5 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMGXB4Q9UGU5 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMGXB4Q9UGU5 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMGXB4Q9UGU5 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMGXB4Q9UGU5 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMGXB4Q9UGU5 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMGXB4Q9UGU5 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HMGXB4Q9UGU5 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMGXB4Q9UGU5 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMGXB4Q9UGU5 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HMGXB4Q9UGU5 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMGXB4Q9UGU5 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMGXB4Q9UGU5 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMGXB4Q9UGU5 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMGXB4Q9UGU5 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HMGXB4Q9UGU5 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HMGXB4Q9UGU5 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HMGXB4Q9UGU5 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HMGXB4Q9UGU5 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms