Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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