Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU7

DBF4, Protein DBF4 homolog A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 674 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBF4Q9UBU7 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DBF4Q9UBU7 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DBF4Q9UBU7 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
DBF4Q9UBU7 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DBF4Q9UBU7 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
DBF4Q9UBU7 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DBF4Q9UBU7 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DBF4Q9UBU7 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DBF4Q9UBU7 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DBF4Q9UBU7 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
DBF4Q9UBU7 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DBF4Q9UBU7 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DBF4Q9UBU7 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DBF4Q9UBU7 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DBF4Q9UBU7 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DBF4Q9UBU7 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DBF4Q9UBU7 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DBF4Q9UBU7 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DBF4Q9UBU7 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DBF4Q9UBU7 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DBF4Q9UBU7 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DBF4Q9UBU7 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DBF4Q9UBU7 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DBF4Q9UBU7 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DBF4Q9UBU7 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DBF4Q9UBU7 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DBF4Q9UBU7 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DBF4Q9UBU7 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DBF4Q9UBU7 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DBF4Q9UBU7 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DBF4Q9UBU7 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DBF4Q9UBU7 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DBF4Q9UBU7 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DBF4Q9UBU7 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
DBF4Q9UBU7 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DBF4Q9UBU7 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DBF4Q9UBU7 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
DBF4Q9UBU7 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DBF4Q9UBU7 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DBF4Q9UBU7 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DBF4Q9UBU7 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DBF4Q9UBU7 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
DBF4Q9UBU7 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DBF4Q9UBU7 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DBF4Q9UBU7 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
DBF4Q9UBU7 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DBF4Q9UBU7 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
DBF4Q9UBU7 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DBF4Q9UBU7 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DBF4Q9UBU7 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
DBF4Q9UBU7 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DBF4Q9UBU7 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DBF4Q9UBU7 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DBF4Q9UBU7 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
DBF4Q9UBU7 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DBF4Q9UBU7 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DBF4Q9UBU7 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DBF4Q9UBU7 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DBF4Q9UBU7 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DBF4Q9UBU7 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DBF4Q9UBU7 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DBF4Q9UBU7 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DBF4Q9UBU7 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
DBF4Q9UBU7 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DBF4Q9UBU7 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DBF4Q9UBU7 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
DBF4Q9UBU7 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DBF4Q9UBU7 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DBF4Q9UBU7 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DBF4Q9UBU7 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DBF4Q9UBU7 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DBF4Q9UBU7 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DBF4Q9UBU7 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DBF4Q9UBU7 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DBF4Q9UBU7 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DBF4Q9UBU7 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DBF4Q9UBU7 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DBF4Q9UBU7 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DBF4Q9UBU7 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DBF4Q9UBU7 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DBF4Q9UBU7 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DBF4Q9UBU7 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DBF4Q9UBU7 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DBF4Q9UBU7 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DBF4Q9UBU7 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
DBF4Q9UBU7 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DBF4Q9UBU7 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DBF4Q9UBU7 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DBF4Q9UBU7 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DBF4Q9UBU7 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DBF4Q9UBU7 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DBF4Q9UBU7 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DBF4Q9UBU7 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DBF4Q9UBU7 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DBF4Q9UBU7 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DBF4Q9UBU7 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
DBF4Q9UBU7 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
DBF4Q9UBU7 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DBF4Q9UBU7 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
DBF4Q9UBU7 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms