Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBL6

CPNE7, Copine-7, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE7Q9UBL6 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CPNE7Q9UBL6 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms