Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J2

IGSF9, Protein turtle homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9Q9P2J2 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGSF9Q9P2J2 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
IGSF9Q9P2J2 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
IGSF9Q9P2J2 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IGSF9Q9P2J2 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IGSF9Q9P2J2 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IGSF9Q9P2J2 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IGSF9Q9P2J2 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IGSF9Q9P2J2 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IGSF9Q9P2J2 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IGSF9Q9P2J2 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IGSF9Q9P2J2 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IGSF9Q9P2J2 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IGSF9Q9P2J2 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IGSF9Q9P2J2 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IGSF9Q9P2J2 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IGSF9Q9P2J2 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IGSF9Q9P2J2 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IGSF9Q9P2J2 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IGSF9Q9P2J2 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IGSF9Q9P2J2 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
IGSF9Q9P2J2 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
IGSF9Q9P2J2 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IGSF9Q9P2J2 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IGSF9Q9P2J2 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IGSF9Q9P2J2 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IGSF9Q9P2J2 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
IGSF9Q9P2J2 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
IGSF9Q9P2J2 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IGSF9Q9P2J2 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IGSF9Q9P2J2 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IGSF9Q9P2J2 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IGSF9Q9P2J2 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
IGSF9Q9P2J2 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IGSF9Q9P2J2 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
IGSF9Q9P2J2 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IGSF9Q9P2J2 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IGSF9Q9P2J2 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IGSF9Q9P2J2 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IGSF9Q9P2J2 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IGSF9Q9P2J2 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IGSF9Q9P2J2 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IGSF9Q9P2J2 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IGSF9Q9P2J2 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IGSF9Q9P2J2 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IGSF9Q9P2J2 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IGSF9Q9P2J2 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IGSF9Q9P2J2 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IGSF9Q9P2J2 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGSF9Q9P2J2 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGSF9Q9P2J2 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGSF9Q9P2J2 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGSF9Q9P2J2 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGSF9Q9P2J2 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGSF9Q9P2J2 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGSF9Q9P2J2 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGSF9Q9P2J2 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGSF9Q9P2J2 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGSF9Q9P2J2 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGSF9Q9P2J2 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGSF9Q9P2J2 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGSF9Q9P2J2 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGSF9Q9P2J2 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
IGSF9Q9P2J2 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGSF9Q9P2J2 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGSF9Q9P2J2 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
IGSF9Q9P2J2 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGSF9Q9P2J2 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGSF9Q9P2J2 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGSF9Q9P2J2 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGSF9Q9P2J2 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGSF9Q9P2J2 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
IGSF9Q9P2J2 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
IGSF9Q9P2J2 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGSF9Q9P2J2 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGSF9Q9P2J2 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
IGSF9Q9P2J2 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGSF9Q9P2J2 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGSF9Q9P2J2 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
IGSF9Q9P2J2 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGSF9Q9P2J2 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGSF9Q9P2J2 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGSF9Q9P2J2 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGSF9Q9P2J2 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
IGSF9Q9P2J2 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGSF9Q9P2J2 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGSF9Q9P2J2 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGSF9Q9P2J2 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGSF9Q9P2J2 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGSF9Q9P2J2 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGSF9Q9P2J2 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGSF9Q9P2J2 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGSF9Q9P2J2 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGSF9Q9P2J2 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGSF9Q9P2J2 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGSF9Q9P2J2 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGSF9Q9P2J2 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGSF9Q9P2J2 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGSF9Q9P2J2 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGSF9Q9P2J2 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms