Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAPAQ9P0L0 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms