Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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CLN6Q9NWW5 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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CLN6Q9NWW5 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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CLN6Q9NWW5 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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CLN6Q9NWW5 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLN6Q9NWW5 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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