Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB4

KRT82, Keratin, type II cuticular Hb2, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT82Q9NSB4 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KRT82Q9NSB4 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms