Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP66

HMG20A, High mobility group protein 20A, humanhuman

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20AQ9NP66 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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