Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
APOBEC3GQ9HC16 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms