Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PHACTR1Q9C0D0 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PHACTR1Q9C0D0 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PHACTR1Q9C0D0 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PHACTR1Q9C0D0 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PHACTR1Q9C0D0 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PHACTR1Q9C0D0 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PHACTR1Q9C0D0 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PHACTR1Q9C0D0 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PHACTR1Q9C0D0 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PHACTR1Q9C0D0 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
PHACTR1Q9C0D0 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PHACTR1Q9C0D0 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PHACTR1Q9C0D0 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PHACTR1Q9C0D0 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHACTR1Q9C0D0 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHACTR1Q9C0D0 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHACTR1Q9C0D0 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHACTR1Q9C0D0 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHACTR1Q9C0D0 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHACTR1Q9C0D0 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHACTR1Q9C0D0 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHACTR1Q9C0D0 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHACTR1Q9C0D0 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHACTR1Q9C0D0 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHACTR1Q9C0D0 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHACTR1Q9C0D0 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHACTR1Q9C0D0 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms