Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRP1Q9C000 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms