Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD9

ACTRT3, Actin-related protein T3, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT3Q9BYD9 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACTRT3Q9BYD9 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms