Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCAPERQ9BY12 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms