Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PACSIN1Q9BY11 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PACSIN1Q9BY11 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PACSIN1Q9BY11 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PACSIN1Q9BY11 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PACSIN1Q9BY11 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PACSIN1Q9BY11 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PACSIN1Q9BY11 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PACSIN1Q9BY11 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PACSIN1Q9BY11 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PACSIN1Q9BY11 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PACSIN1Q9BY11 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PACSIN1Q9BY11 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PACSIN1Q9BY11 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PACSIN1Q9BY11 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PACSIN1Q9BY11 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PACSIN1Q9BY11 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PACSIN1Q9BY11 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PACSIN1Q9BY11 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PACSIN1Q9BY11 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PACSIN1Q9BY11 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PACSIN1Q9BY11 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PACSIN1Q9BY11 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PACSIN1Q9BY11 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PACSIN1Q9BY11 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PACSIN1Q9BY11 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PACSIN1Q9BY11 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PACSIN1Q9BY11 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PACSIN1Q9BY11 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PACSIN1Q9BY11 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PACSIN1Q9BY11 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PACSIN1Q9BY11 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PACSIN1Q9BY11 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PACSIN1Q9BY11 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PACSIN1Q9BY11 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PACSIN1Q9BY11 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PACSIN1Q9BY11 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PACSIN1Q9BY11 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PACSIN1Q9BY11 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PACSIN1Q9BY11 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PACSIN1Q9BY11 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PACSIN1Q9BY11 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PACSIN1Q9BY11 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN1Q9BY11 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN1Q9BY11 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN1Q9BY11 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN1Q9BY11 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN1Q9BY11 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN1Q9BY11 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN1Q9BY11 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN1Q9BY11 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN1Q9BY11 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN1Q9BY11 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN1Q9BY11 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN1Q9BY11 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN1Q9BY11 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN1Q9BY11 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN1Q9BY11 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN1Q9BY11 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN1Q9BY11 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN1Q9BY11 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN1Q9BY11 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN1Q9BY11 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN1Q9BY11 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN1Q9BY11 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN1Q9BY11 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN1Q9BY11 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN1Q9BY11 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN1Q9BY11 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN1Q9BY11 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN1Q9BY11 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN1Q9BY11 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN1Q9BY11 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN1Q9BY11 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN1Q9BY11 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN1Q9BY11 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN1Q9BY11 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN1Q9BY11 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN1Q9BY11 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN1Q9BY11 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN1Q9BY11 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN1Q9BY11 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN1Q9BY11 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN1Q9BY11 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN1Q9BY11 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN1Q9BY11 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN1Q9BY11 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN1Q9BY11 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN1Q9BY11 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PACSIN1Q9BY11 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PACSIN1Q9BY11 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PACSIN1Q9BY11 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PACSIN1Q9BY11 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PACSIN1Q9BY11 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PACSIN1Q9BY11 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PACSIN1Q9BY11 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PACSIN1Q9BY11 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PACSIN1Q9BY11 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PACSIN1Q9BY11 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PACSIN1Q9BY11 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms