Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms