Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms