Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TREX2Q9BQ50 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TREX2Q9BQ50 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms