Protein–RNA interactions for Protein: Q96T59

CDRT15, CMT1A duplicated region transcript 15 protein, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT15Q96T59 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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CDRT15Q96T59 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDRT15Q96T59 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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