Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FGD4Q96M96 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FGD4Q96M96 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FGD4Q96M96 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FGD4Q96M96 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FGD4Q96M96 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FGD4Q96M96 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FGD4Q96M96 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FGD4Q96M96 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FGD4Q96M96 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FGD4Q96M96 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FGD4Q96M96 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FGD4Q96M96 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FGD4Q96M96 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FGD4Q96M96 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FGD4Q96M96 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FGD4Q96M96 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FGD4Q96M96 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FGD4Q96M96 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FGD4Q96M96 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FGD4Q96M96 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FGD4Q96M96 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FGD4Q96M96 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FGD4Q96M96 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FGD4Q96M96 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FGD4Q96M96 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FGD4Q96M96 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
FGD4Q96M96 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FGD4Q96M96 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FGD4Q96M96 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
FGD4Q96M96 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FGD4Q96M96 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FGD4Q96M96 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FGD4Q96M96 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FGD4Q96M96 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
FGD4Q96M96 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FGD4Q96M96 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FGD4Q96M96 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FGD4Q96M96 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FGD4Q96M96 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
FGD4Q96M96 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FGD4Q96M96 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FGD4Q96M96 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FGD4Q96M96 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FGD4Q96M96 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FGD4Q96M96 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FGD4Q96M96 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FGD4Q96M96 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FGD4Q96M96 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FGD4Q96M96 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FGD4Q96M96 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FGD4Q96M96 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FGD4Q96M96 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FGD4Q96M96 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FGD4Q96M96 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FGD4Q96M96 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FGD4Q96M96 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FGD4Q96M96 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FGD4Q96M96 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FGD4Q96M96 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FGD4Q96M96 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FGD4Q96M96 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FGD4Q96M96 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FGD4Q96M96 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FGD4Q96M96 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FGD4Q96M96 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FGD4Q96M96 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
FGD4Q96M96 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FGD4Q96M96 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FGD4Q96M96 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FGD4Q96M96 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FGD4Q96M96 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FGD4Q96M96 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FGD4Q96M96 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FGD4Q96M96 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FGD4Q96M96 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FGD4Q96M96 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
FGD4Q96M96 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
FGD4Q96M96 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
FGD4Q96M96 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FGD4Q96M96 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FGD4Q96M96 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FGD4Q96M96 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FGD4Q96M96 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FGD4Q96M96 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FGD4Q96M96 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FGD4Q96M96 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FGD4Q96M96 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FGD4Q96M96 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FGD4Q96M96 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FGD4Q96M96 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FGD4Q96M96 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FGD4Q96M96 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FGD4Q96M96 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FGD4Q96M96 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FGD4Q96M96 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FGD4Q96M96 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FGD4Q96M96 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FGD4Q96M96 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FGD4Q96M96 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms