Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EP400Q96L91 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EP400Q96L91 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EP400Q96L91 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EP400Q96L91 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EP400Q96L91 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
EP400Q96L91 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EP400Q96L91 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EP400Q96L91 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EP400Q96L91 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EP400Q96L91 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
EP400Q96L91 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
EP400Q96L91 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EP400Q96L91 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EP400Q96L91 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
EP400Q96L91 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
EP400Q96L91 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EP400Q96L91 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
EP400Q96L91 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EP400Q96L91 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EP400Q96L91 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EP400Q96L91 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EP400Q96L91 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EP400Q96L91 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EP400Q96L91 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
EP400Q96L91 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EP400Q96L91 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EP400Q96L91 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EP400Q96L91 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EP400Q96L91 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EP400Q96L91 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EP400Q96L91 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EP400Q96L91 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EP400Q96L91 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EP400Q96L91 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EP400Q96L91 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EP400Q96L91 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EP400Q96L91 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
EP400Q96L91 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EP400Q96L91 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
EP400Q96L91 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EP400Q96L91 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EP400Q96L91 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EP400Q96L91 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EP400Q96L91 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EP400Q96L91 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EP400Q96L91 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EP400Q96L91 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EP400Q96L91 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
EP400Q96L91 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
EP400Q96L91 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EP400Q96L91 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EP400Q96L91 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EP400Q96L91 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EP400Q96L91 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
EP400Q96L91 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EP400Q96L91 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EP400Q96L91 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EP400Q96L91 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EP400Q96L91 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EP400Q96L91 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EP400Q96L91 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EP400Q96L91 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EP400Q96L91 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EP400Q96L91 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EP400Q96L91 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EP400Q96L91 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EP400Q96L91 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EP400Q96L91 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EP400Q96L91 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
EP400Q96L91 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EP400Q96L91 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EP400Q96L91 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
EP400Q96L91 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EP400Q96L91 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
EP400Q96L91 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
EP400Q96L91 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
EP400Q96L91 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
EP400Q96L91 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
EP400Q96L91 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
EP400Q96L91 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
EP400Q96L91 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
EP400Q96L91 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
EP400Q96L91 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
EP400Q96L91 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
EP400Q96L91 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
EP400Q96L91 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EP400Q96L91 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EP400Q96L91 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EP400Q96L91 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EP400Q96L91 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
EP400Q96L91 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EP400Q96L91 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
EP400Q96L91 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EP400Q96L91 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EP400Q96L91 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
EP400Q96L91 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EP400Q96L91 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EP400Q96L91 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EP400Q96L91 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms