Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRIQ1Q96JM4 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRIQ1Q96JM4 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRIQ1Q96JM4 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRIQ1Q96JM4 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRIQ1Q96JM4 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRIQ1Q96JM4 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRIQ1Q96JM4 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRIQ1Q96JM4 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRIQ1Q96JM4 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRIQ1Q96JM4 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRIQ1Q96JM4 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRIQ1Q96JM4 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRIQ1Q96JM4 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRIQ1Q96JM4 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRIQ1Q96JM4 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
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