Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHDQ96IW2 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHDQ96IW2 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms