Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BORCS6Q96GS4 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms