Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC9

OTUB2, Ubiquitin thioesterase OTUB2, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB2Q96DC9 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OTUB2Q96DC9 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms